WEKO3
アイテム
SPR interaction analysis of GM3 glycan with the integrin α5β1 head domain
https://repository.lib.tottori-u.ac.jp/records/2002494
https://repository.lib.tottori-u.ac.jp/records/2002494b201563b-374d-4ce7-bf78-59ae65bf087e
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
Glycoconjugate J43(1)_5.pdf (1.5 MB)
Download is available from 2027/1/7.
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This version of the article has been accepted for publication, after peer review (when applicable) and is subject to Springer Nature’s AM terms of use, but is not the Version of Record and does not reflect post-acceptance improvements, or any corrections. The Version of Record is available online at: https://doi.org/10.1007/s10719-025-10205-x
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| アイテムタイプ | デフォルトアイテムタイプ（フル）(1) | |||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2026-09-07 | |||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||
| タイトル | SPR interaction analysis of GM3 glycan with the integrin α5β1 head domain | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 作成者 |
花島, 慎弥
× 花島, 慎弥
研究者総覧鳥取大学
100002461_ja.html
× Kishi, Migiwa
× 佐々木, 克聡
研究者総覧鳥取大学
100002664_ja.html
× 佐藤, 裕介
研究者総覧鳥取大学
100002154_ja.html
× 村田, 道雄
e-Rad_Researcher
40183652
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| 主題 | ||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | Ganglioside | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | ||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | Integrin | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | ||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | Chemoenzymatic synthesis | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | ||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | SPR | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | ||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | Docking study | |||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | ||||||||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | Integrins are heterodimeric receptors involved in cell adhesion and bidirectional signaling. Ganglioside GM3 in the outer leaflet of cell membranes possibly regulates integrin activity via direct interactions; however, its specific binding mode with integrins remains unclear. Therefore, in this study, we focused on the GM3 glycan moiety, which encounters the integrin ectodomain on the cell surface, and synthesized a soluble GM3 probe without hydrocarbon chains using a chemoenzymatic approach. Binding analysis using surface plasmon resonance (SPR) indicated that the synthetic GM3 probe interacted with the integrin α5β1 ectodomain with a significantly higher affinity than the lactosylceramide probe. Saturation transfer difference (STD) NMR spectra suggested that the integrin α5β1 ectodomain interacts with N-acetylneuraminic acid (Neu5Ac) at the GM3 terminal and α2-3Gal linkage. Notably, RGD peptide, an integrin ligand interacting with the heterodimer interface, competed with GM3 to bind to integrin α5β1 on the SPR sensor chip. Consistent with these results, the GM3 binding site predicted by Chai-1 partially overlapped with the RGD peptide-binding groove on integrin α5β1; however, the binding mode was different. RGD peptide bridged the α and β subunits of the integrin head moiety, whereas the GM3 probe found at the cleft between the subunits. The Neu5Ac Gal moiety primarily interacted with the metal ion-dependent adhesion site and nearby residues in the β1 subunit. Overall, our findings suggest that gangliosides directly interact with integrin α5β1 at a previously unknown binding site, revealing a novel regulatory mechanism for the integrin activity. | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | Springer Nature | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 日付 | ||||||||||||||||||||||||
| 日付 | 2026-12 | |||||||||||||||||||||||
| 日付タイプ | Issued | |||||||||||||||||||||||
| 日付 | ||||||||||||||||||||||||
| 日付 | 2027-01-07 | |||||||||||||||||||||||
| 日付タイプ | Available | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | journal article | |||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | ||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | AM | |||||||||||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa | |||||||||||||||||||||||
| 関連情報 | ||||||||||||||||||||||||
| 関連タイプ | isVersionOf | |||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | DOI | |||||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | https://doi.org/10.1007/s10719-025-10205-x | |||||||||||||||||||||||
| 助成情報 | ||||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | e-Rad_funder | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関識別子 | 1025 | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関識別子タイプURI | https://www.e-rad.go.jp/datasets/files/haibunkikan.csv | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関名 | 独立行政法人日本学術振興会 | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関名 | Japan Society for the Promotion of Science | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||
| プログラム情報 | 科学研究費助成事業 | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| プログラム情報 | Grants-in-Aid for Scientific Research (KAKENHI) | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題番号タイプ | JGN | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題番号 | JP23K17373 | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題番号URI | https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23K17373/ | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題名 | 生体膜に現れる脂質ドメイン構造を司る脂質アシル鎖の平均配向 | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題名 | Average orientation of lipid acyl chains in the domain structure of model membranes | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 助成情報 | ||||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | e-Rad_funder | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関識別子 | 1025 | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関識別子タイプURI | https://www.e-rad.go.jp/datasets/files/haibunkikan.csv | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関名 | 独立行政法人日本学術振興会 | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関名 | Japan Society for the Promotion of Science | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||
| プログラム情報 | 科学研究費助成事業 | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| プログラム情報 | Grants-in-Aid for Scientific Research (KAKENHI) | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題番号タイプ | JGN | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題番号 | JP24K21253 | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題番号URI | https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24K21253/ | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題名 | 生理活性糖リン脂質の新たな合成反応―細胞表面の直接的糖修飾への応用と機能解明 | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題名 | Novel method for synthesis of Phosphatidylglucoside: applied to cell surface glycosylation | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 助成情報 | ||||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | e-Rad_funder | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関識別子 | 1025 | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関識別子タイプURI | https://www.e-rad.go.jp/datasets/files/haibunkikan.csv | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関名 | 独立行政法人日本学術振興会 | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関名 | Japan Society for the Promotion of Science | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||
| プログラム情報 | 科学研究費助成事業 | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| プログラム情報 | Grants-in-Aid for Scientific Research (KAKENHI) | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題番号タイプ | JGN | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題番号 | JP23K17993 | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題番号URI | https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23K17993/ | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題名 | 植物特有のスフィンゴ脂質の構造と相互作用が誘起する脂質ラフトの描像の構築 | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||
| 助成情報 | ||||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | e-Rad_funder | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関識別子 | 1025 | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関識別子タイプURI | https://www.e-rad.go.jp/datasets/files/haibunkikan.csv | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関名 | 独立行政法人日本学術振興会 | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関名 | Japan Society for the Promotion of Science | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||
| プログラム情報 | 科学研究費助成事業 | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| プログラム情報 | Grants-in-Aid for Scientific Research (KAKENHI) | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題番号タイプ | JGN | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題番号 | JP24K17801 | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題番号URI | https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24K17801/ | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題名 | 膜受容体を標的とした間接的プローブ分子化法の開発と生細胞への応用 | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||
| 助成情報 | ||||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | e-Rad_funder | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関識別子 | 1020 | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関識別子タイプURI | https://www.e-rad.go.jp/datasets/files/haibunkikan.csv | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関名 | 国立研究開発法人科学技術振興機構 | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||
| 助成機関名 | Japan Science and Technology Agency | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| プログラム情報識別子タイプ | JGN_fundingStream | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題番号タイプ | MJCR | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||
| プログラム情報 | 研究推進事業新技術シーズ創出 | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| プログラム情報 | CREST | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題番号タイプ | JGN | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題番号 | JPMJCR18H2 | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題番号URI | https://doi.org/10.52926/JPMJCR18H2 | |||||||||||||||||||||||
| 研究課題名 | 高精度1分子観察によるエクソソーム膜動態の解明 | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | ||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | PISSN | |||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 02820080 | |||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | ||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | EISSN | |||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 15734986 | |||||||||||||||||||||||
| 書誌情報 |
en : Glycoconjugate Journal 巻 43, 号 1, p. 5, 発行日 2026-12 |
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| 出版者情報 | ||||||||||||||||||||||||
| 出版者名 | Springer Nature | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| アクセス権 | ||||||||||||||||||||||||
| アクセス権 | embargoed access | |||||||||||||||||||||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_f1cf | |||||||||||||||||||||||
| 権利情報 | ||||||||||||||||||||||||
| 権利情報 | This version of the article has been accepted for publication, after peer review (when applicable) and is subject to Springer Nature’s AM terms of use, but is not the Version of Record and does not reflect post-acceptance improvements, or any corrections. The Version of Record is available online at: https://doi.org/10.1007/s10719-025-10205-x | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 権利情報 | ||||||||||||||||||||||||
| 権利情報 | Springer Nature or its licensor (e.g. a society or other partner) holds exclusive rights to this article under a publishing agreement with the author(s) or other rightsholder(s); author self-archiving of the accepted manuscript version of this article is solely governed by the terms of such publishing agreement and applicable law. | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
