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Detection of Disease-specific Fusion Genes of Soft Tissue Tumors Using Formalin-fixed Paraffin-embedded Tissues; Its Diagnostic Usefulness and Factors Affecting the Detection Rates
名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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yam62(1)_115.pdf (989.7 kB)
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Item type | 学術雑誌論文 / Journal Article(1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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公開日 | 2019-06-17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
タイトル | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
タイトル | Detection of Disease-specific Fusion Genes of Soft Tissue Tumors Using Formalin-fixed Paraffin-embedded Tissues; Its Diagnostic Usefulness and Factors Affecting the Detection Rates | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
言語 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
言語 | eng | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
主題 | fusion gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
主題 | reverse transcription polymerase chain reaction | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
主題 | soft tissue tumor | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
主題 | fusion gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
主題 | reverse transcription polymerase chain reaction | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
主題 | soft tissue tumor | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
資源タイプ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
資源タイプ | journal article | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
著者 |
Matsushige, Takahiro
× Matsushige, Takahiro× Kuwamoto, Satoshi
WEKO
1855
× Matsushita, Michiko
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2075
× Oka, Wardhani Lusi× Horie, Yasushi
WEKO
791
× Hayashi, Kazuhiko
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660
× Kitamura, Yukisato
WEKO
1585
× Matsushige, Takahiro× Oka, Wardhani Lusi |
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著者所属 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
値 | Department of Pathobiological Science and Technology, Major in Clinical Laboratory Science, School of Health Science, Tottori University Faculty of Medicine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
著者所属 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
値 | Department of Pathology, Tottori University Hospital/Division of Molecular Pathology, Department of Pathology, School of Medicine, Tottori University Faculty of Medicine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
著者所属 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
値 | Department of Pathobiological Science and Technology, Major in Clinical Laboratory Science, School of Health Science, Tottori University Faculty of Medicine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
著者所属 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
値 | Division of Molecular Pathology, Department of Pathology, School of Medicine, Tottori University Faculty of Medicine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
著者所属 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
値 | Department of Pathology, Tottori University Hospital | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
著者所属 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
値 | Division of Molecular Pathology, Department of Pathology, School of Medicine, Tottori University Faculty of Medicine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
著者所属 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
値 | Department of Pathobiological Science and Technology, Major in Clinical Laboratory Science, School of Health Science, Tottori University Faculty of Medicine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
著者所属(英) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
値 | Department of Pathobiological Science and Technology, Major in Clinical Laboratory Science, School of Health Science, Tottori University Faculty of Medicine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
著者所属(英) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
値 | Department of Pathology, Tottori University Hospital/Division of Molecular Pathology, Department of Pathology, School of Medicine, Tottori University Faculty of Medicine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
著者所属(英) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
値 | Department of Pathobiological Science and Technology, Major in Clinical Laboratory Science, School of Health Science, Tottori University Faculty of Medicine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
著者所属(英) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
値 | Division of Molecular Pathology, Department of Pathology, School of Medicine, Tottori University Faculty of Medicine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
著者所属(英) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
値 | Department of Pathology, Tottori University Hospital | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
著者所属(英) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
値 | Division of Molecular Pathology, Department of Pathology, School of Medicine, Tottori University Faculty of Medicine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
著者所属(英) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
値 | Department of Pathobiological Science and Technology, Major in Clinical Laboratory Science, School of Health Science, Tottori University Faculty of Medicine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
抄録 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
内容記述タイプ | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
内容記述 | [Background] Recent rapid advances in molecular biology have led the discovery of disease-specific novel fusion genes in a variety of soft tissue tumors. In this study, we attempted to detect these fusion genes using formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tumor tissues and investigated their clinical utility and factors that affect the results of examination. [Methods] Reverse transcription polymerase chain reaction for the detection of tumor-specific fusion genes was performed using 41 FFPE tumor samples obtained from 37 patients representing nine histological types of soft tissue tumors that were diagnosed from 2006 to 2017 in our laboratory. [Results] Fusion genes in 19 (51.3%) out of 37 cases were detected successfully. Relatively high detection rates were observed in synovial sarcomas (100%, 4/4) and alveolar rhabdomyosarcomas (75%, 3/4). The detection rates of fusion genes were inversely correlated with the storage period of FFPE blocks. Decalcification by Plank-Rychlo solution significantly affected detection rates of the internal control gene (P = 0.0038). In contrast, there was no significant difference in detection rates between primary and metastatic lesion, or biopsy and resection material, or presence and absence of treatment history. [Conclusion] In certain histological types, detection of disease-specific fusion genes of soft tissue tumors using FFPE tissues showed high sensitivity and thus had diagnostic utility. However, due to the diversity of fusion patterns and the low-quality of nucleic acid, the detection rate as a whole was sluggish and required further improvement. For factors affecting the detection results, our results suggested that it was impossible to detect fusion genes by decalcified FFPE tissues, but it may be not necessary to consider factors such as the type of specimen (biopsy or resection) and treatment history of the patients when selecting the FFPE tissues. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
書誌情報 |
Yonago Acta Medica en : Yonago Acta Medica 巻 62, 号 1, p. 115-123, 発行日 2019-03-28 |
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出版者 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
出版者 | Tottori University Medical Press | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
ISSN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
収録物識別子 | 05135710 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
書誌レコードID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
収録物識別子 | AA00892882 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
DOI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
関連タイプ | isIdenticalTo | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
識別子タイプ | DOI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
関連識別子 | 10.33160/yam.2019.03.016 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
権利 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
権利情報 | Yonago Acta medica 編集委員会 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
情報源 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
関連名称 | Yonago Acta Medica. 2019, 62(1), 115-123 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
関連サイト | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
識別子タイプ | URI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
関連識別子 | https://www.jstage.jst.go.jp/article/yam/62/1/62_2019.03.016/_article/-char/en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
関連名称 | https://www.jstage.jst.go.jp/article/yam/62/1/62_2019.03.016/_article/-char/en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
関連サイト | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
識別子タイプ | URI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
関連識別子 | http://www.lib.tottori-u.ac.jp/yam/yam/yam62-1/62-1contents.html | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
関連名称 | http://www.lib.tottori-u.ac.jp/yam/yam/yam62-1/62-1contents.html | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
著者版フラグ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
出版タイプ | VoR | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EISSN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
値 | 1346-8049 |