WEKO3
アイテム
Expression of housekeeping genes varies depending on mevalonate pathway inhibition in cancer cells
https://repository.lib.tottori-u.ac.jp/records/2001697
https://repository.lib.tottori-u.ac.jp/records/20016971730f0a7-df3c-41c0-9f0c-17b3fdd3474e
名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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![]() |
Item type | デフォルトアイテムタイプ(フル)(1) | |||||||||||||||||||||||||
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公開日 | 2025-02-12 | |||||||||||||||||||||||||
タイトル | ||||||||||||||||||||||||||
タイトル | Expression of housekeeping genes varies depending on mevalonate pathway inhibition in cancer cells | |||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||
作成者 |
Irie,Nanami
× Irie,Nanami
× 割田,克彦
WEKO
4668
× Tashiro,Jiro
× Zhou,Yaxuan
× Ishikawa,Takuro
× Oltvai,Zoltán N
× Warita,Tomoko
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主題 | ||||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||
主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||
主題 | Mevalonate pathway | |||||||||||||||||||||||||
主題 | ||||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||
主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||
主題 | Cancer cells | |||||||||||||||||||||||||
主題 | ||||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||
主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||
主題 | Statins | |||||||||||||||||||||||||
主題 | ||||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||
主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||
主題 | Housekeeping genes | |||||||||||||||||||||||||
主題 | ||||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||
主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||
主題 | RT-qPCR | |||||||||||||||||||||||||
主題 | ||||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||
主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||
主題 | Optimal internal reference genes | |||||||||||||||||||||||||
内容記述 | ||||||||||||||||||||||||||
内容記述タイプ | Other | |||||||||||||||||||||||||
内容記述 | Statins have anticancer effects and may be used as anticancer agents via drug repositioning. In reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) assays, the internal reference gene must not be affected by any experimental conditions. As statins exert a wide range of effects on cells by inhibiting the mevalonate pathway, it is possible that statin treatment might alter the expression of housekeeping genes used as internal reference genes, thereby misleading the assessment of obtained gene expression data. Here, we evaluated the expression stability of internal reference genes in atorvastatin-treated cancer cell lines. We treated both statin-sensitive and statin-resistant cancer cell lines with atorvastatin at seven different concentrations and performed RT-qPCR on 15 housekeeping genes whose expression stability was then assessed using five different algorithms. In both statin-sensitive and statin-resistant cancer cell lines, atorvastatin affected the expression of certain internal reference genes in a dose-dependent and cancer cell line-dependent manner; therefore, caution should be exercised when comparing target gene expression between cells. Our findings emphasize the importance of the validation of internal reference genes in gene expression analyses in drug treatment-based cancer research. | |||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||
出版者 | ||||||||||||||||||||||||||
出版者 | Elsevier BV | |||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||
日付 | ||||||||||||||||||||||||||
日付 | 2023-07-08 | |||||||||||||||||||||||||
日付タイプ | Issued | |||||||||||||||||||||||||
言語 | ||||||||||||||||||||||||||
言語 | eng | |||||||||||||||||||||||||
資源タイプ | ||||||||||||||||||||||||||
資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||||||||||
資源タイプ | journal article | |||||||||||||||||||||||||
出版タイプ | ||||||||||||||||||||||||||
出版タイプ | VoR | |||||||||||||||||||||||||
出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||||||||||||||||||||
関連情報 | ||||||||||||||||||||||||||
関連タイプ | isIdenticalTo | |||||||||||||||||||||||||
識別子タイプ | DOI | |||||||||||||||||||||||||
関連識別子 | https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2023.e18017 | |||||||||||||||||||||||||
収録物識別子 | ||||||||||||||||||||||||||
収録物識別子タイプ | EISSN | |||||||||||||||||||||||||
収録物識別子 | 24058440 | |||||||||||||||||||||||||
収録物名 | ||||||||||||||||||||||||||
収録物名 | Heliyon | |||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||
巻 | ||||||||||||||||||||||||||
巻 | 9 | |||||||||||||||||||||||||
号 | ||||||||||||||||||||||||||
号 | 7 | |||||||||||||||||||||||||
開始ページ | ||||||||||||||||||||||||||
開始ページ | e18017 | |||||||||||||||||||||||||
書誌情報 |
en : Heliyon 巻 9, 号 7, p. e18017, 発行日 2023-07-08 |
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アクセス権 | ||||||||||||||||||||||||||
アクセス権 | open access | |||||||||||||||||||||||||
アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |||||||||||||||||||||||||
権利情報 | ||||||||||||||||||||||||||
言語 | en | |||||||||||||||||||||||||
権利情報 | (C) 2023 The Authors. Published by Elsevier Ltd. This is an open access article under the CC BY license (http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/). |